Целью деятельности Департамента является эффективное управление региональными финансами и совершенствование межбюджетных отношений в Томской области.

Задачами деятельности Департамента являются:

1) обеспечение сбалансированности и устойчивости региональных финансов при формировании и исполнении областного бюджета;
2) эффективное управление государственным долгом;
3) создание условий для обеспечения равных финансовых возможностей муниципальных образований по решению вопросов местного значения;
4) внедрение механизмов, направленных на повышение эффективности и прозрачности региональных и муниципальных финансов.